宫颈鳞癌放疗抵抗中异常表达lncRNA相关ceRNA网络的 构建与分析

• 作者: 任遥瑶 吴南昌 宋红林 李世婷 陈昌贤 陶珊
• 来源期刊: 广西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 宫颈鳞癌 放疗抵抗 竞争性内源性RNA 长链非编码RNA 癌症基因组图谱
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 23-28
• 页数: 6页
• 分类号: R711.74
• 字数: 3480字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2020.01.003

摘要

目的:旨在基于TCGA数据库构建宫颈鳞状细胞癌(CSCC)放疗抵抗竞争性内源性RNA(ceRNA)网络,鉴定潜在的预测放疗疗效生物标志物及探讨放疗抵抗的机制.方法:依据纳入研究标准在TCGA数据库的宫颈癌数据集中筛选出23个CSCC放疗抵抗与67个放疗敏感样本的RNA表达谱数据,运行R"edger"包鉴定差异表达lncRNAs、miRNAs和mRNAs,基于miRcode、TargetScan和miRTarBase数据库构建ceRNA网络并通过Cytoscape软件可视化.进一步结合KEGG、GO及生存分析等生物信息学方法筛选出关键分子.结果:设定阈值为|log2差异倍数(FC)|>1.5且FDR<0.05,共鉴定出237个DElncRNAs,16个DEmiRNAs和565个DEmRNAs,其中17个DElncRNAs、3个DEmiRNAs和15个DEm-RNAs参与构建ceRNA网络.DEmRNAs富集到3个GO术语和8个KEGG途径(P<0.05).5个DElncRNAs在不同临床病理特征中有显著差异(|log2FC|>2且FDR<0.05).结论:成功构建CSCC放疗抵抗特异性lncRNA相关的ceRNA网络,鉴定了预测CSCC放疗疗效分子标志物,为理解CSCC产生放疗抵抗的机制提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋红林	广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科	34	185	9.0	12.0
2	陈昌贤	广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科	18	84	4.0	8.0
3	吴南昌		1	0	0.0	0.0
4	陶珊		1	0	0.0	0.0
5	李世婷		1	0	0.0	0.0
6	任遥瑶		1	0	0.0	0.0