蛋白芯片检测技术结合多维统计推断死亡时间

• 作者: 卢晓军 姜垚如 孙俊红 李健 李文晋 王英元 王靓 靳茜茜
• 来源期刊: 法医学杂志
• 学科: 政治法律
• 关键词: 法医病理学 芯片分析技术 蛋白质类 死亡时间 肝 大鼠
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 660-665,671
• 页数: 7页
• 分类号: DF795.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2020.05.010

摘要

目的 利用2100生物分析仪结合蛋白芯片获取死后大鼠肝组织蛋白质表达谱,推测其与死亡时间的关系.方法 大鼠腹腔麻醉致死后置于16℃环境中,提取死后14个时间点肝组织中的水溶性蛋白质,使用蛋白芯片获取相对分子质量在14000～230000的蛋白质表达谱数据,并利用主成分分析(principal component analysis,PCA)、偏最小二乘-判别分析(partial least squares-discriminant analysis,PLS-DA)、Fisher判别对数据进行分析.结果 根据蛋白质表达谱的变化和PLS-DA结果将死亡时间分为A组(0 d)、B组(1～9 d)、C组(12～30 d).经Fisher判别,模型的训练集及测试集的预测准确率均为100.0％,训练集的内部交叉验证准确率为100.0％.通过建立B、C组各时间点的Fisher判别模型缩小推断死亡时间窗口,B组中训练集及测试集的预测准确率均为100.0％,训练集的内部交叉验证准确率为100.0％;C组中训练集及测试集的预测准确率分别为95.2％、78.6％,训练集的内部交叉验证准确率为88.1％.结论 蛋白芯片检测技术可以快捷简便地获取大鼠死后不同时间点肝组织相对分子质量在14000～230000的水溶性蛋白质表达谱,建立PLS-DA及Fisher判别模型对死亡时间进行分类预测判断,有望为死亡时间推断提供新的思路和方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙俊红		68	201	7.0	9.0
2	王英元		165	902	15.0	21.0
3	李文晋		31	99	5.0	8.0
4	李健		6	15	2.0	3.0
5	靳茜茜		11	38	4.0	6.0
6	卢晓军		2	0	0.0	0.0
7	姜垚如		1	0	0.0	0.0
8	王靓		1	0	0.0	0.0