珍稀濒危物种双蕊兰根际土壤细菌多样性研究

• 作者: 周强 孙冬伟 李海燕 岳杰 陈旭辉 曲波 张丽杰
• 来源期刊: 沈阳农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 双蕊兰 根际细菌 高通量测序
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 721-726
• 页数: 6页
• 分类号: Q938.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1700.2020.06.11

摘要

双蕊兰(Diplandrorchis sinica)为兰科单种属孓遗植物,其罕见的原始类型在兰科植物系统进化和发育研究上具有重要意义.为从分子水平探讨根际土壤细菌对双蕊兰濒危机制的影响,通过选取双蕊兰肉质根0～4mm的根际土,基于Illumina Miseq测序平台对濒危物种双蕊兰根际土壤细菌16S rRNA基因的V3～V4高变区片段进行高通量测序.结果表明:测序共获得26690条16S rRNA原始序列,深度测序获得为26471条有效基因序列.基于≥97％的相似度水平,对有效序列利用QIIME软件处理操作分类单元,聚类分析后共获得9556个OTUs.Illumina Miseq高通量测序显示,双蕊兰根际土壤细菌呈多样性分布,且在门、纲、目、科、属分类水平上的优势类群较为突出,主要涵盖了变形菌门(Proteobacteria),放线菌门(Actinobacteria),拟杆菌门(Bacteroiteria),酸杆菌门(Acidobacteria),疣微菌门(Verrucomicrobia).其中,变形菌门和放线菌门为优势菌群,两者相对丰度之和达到61.80％.双蕊兰根际土壤细菌多样性在门、纲、目、科、属分类水平上的优势细菌类群主要为变形菌门(Protecbacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、根瘤菌目(Rhizobiales)、生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)和未被确定分类的盖氏菌属(UnclassifiedGaiellaceae).