荧光聚合酶链反应检测血液标本快速方法的建立及其在ADRB1单核苷酸多态性分型中的应用

• 作者: 李佳 黄凯峰 龚如涵
• 来源期刊: 诊断学理论与实践
• 学科: 医学
• 关键词: 荧光聚合酶链反应 直接扩增 ADRB1基因 Sanger测序
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 402-406
• 页数: 5页
• 分类号: R446.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.16150/j.1671-2870.2020.04.015

摘要

目的:建立一种荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)检测血液标本的快速方法,并将其应用到ADRB1(1165G>C)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分型检测中.方法:建立可直接利用血液样本进行荧光PCR扩增法,与传统血液样本的基因SNP检测方法不同,本所建立的方法无需进行血液基因组DNA的提取.选取1051份临床乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA)抗凝全血样本,利用本研究建立的采用血液标本直接扩增的荧光PCR方法,进行ADRB1的SNP分型,并将分型结果与Sanger测序法这一"金标准"进行对比,评估两者之间的符合率和一致性.结果:本研究建立的方法与传统DNA提取加荧光PCR方法相比,具有较好的扩增性能;与Sanger测序法相比,本研究建立的方法在ADRB1(1165G>C)基因SNP分型检测中的总体符合率达到98.98％,Kappa一致性系数达到0.971,具有较高的准确率.结论:与传统方法相比,本研究建立的方法可省略基因组DNA提取步骤,其操作简便、成本较低,且准确率高,适合在基因分型相关临床检验工作中推广和使用.