结肠癌化疗耐药相关miRNA表达谱的初步研究

• 作者: 宋学 张锦松 徐霖 陈两洲 陈敏
• 来源期刊: 中国病理生理杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 结肠癌 化疗 耐药性 微小RNA 基因芯片 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 短篇论著
• 页码范围: 175-180
• 页数: 6页
• 分类号: R363.2|R735.3+5
• 字数: 4222字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4718.2020.01.026

摘要

目的:应用基因芯片技术筛选结肠癌耐药相关微小RNAs (miRNAs),探究miRNAs对化疗耐药的调控机制.方法:采用基因芯片技术分析结肠癌细胞系HCT8及其耐长春新碱细胞系HCT8/v中miRNAs的表达差异,对部分差异表达的miRNAs应用RT-qPCR进行验证,对表达差异显著的miRNAs进行靶基因预测,利用GeneOntology (GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对预测到的靶基因进行生物信息学分析.结果:筛选出342个差异表达miRNAs,其中190个表达上调,152个表达下调.RT-qPCR验证结果示miR-125-5p、miR-1 81 c-5p和miR-153-3的表达情况和芯片检测结果一致;miR-130a-3p和miR-149-3p的表达与芯片检测结果不一致.GO分析结果显示,耐药相关基因主要富集的旁路是RNA聚合酶Ⅱ调控区序列特异性DNA结合旁路,主要通过正向调节发挥作用,位置主要是在细胞内有界细胞器上.KEGG分析结果显示,耐药相关基因最为富集的是轴突导向通路、胰岛素信号通路及磷脂酶D信号通路.结论:miRNAs与结肠癌化疗耐药密切相关.对这些miRNAs的研究能使我们对结肠癌的化疗耐药机制有更深入的理解,并为逆转化疗耐药提供新的思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈敏	北京中医药大学厦门医院普外科	4	3	1.0	1.0
2	张锦松	北京中医药大学厦门医院普外科	1	0	0.0	0.0
3	徐霖	北京中医药大学厦门医院普外科	1	0	0.0	0.0
4	陈两洲	北京中医药大学厦门医院普外科	1	0	0.0	0.0
5	宋学	北京中医药大学厦门医院普外科	1	0	0.0	0.0