基因可变剪切差异对蛋鸡首次产蛋前后肝脏细胞内吞功能的影响

• 作者: 刘悦磊 张玳维 张臻 朱文进 朱芷葳 李慧锋 石雄 黄翔
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 肝脏 可变剪切 内吞作用 转录组
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 78-84
• 页数: 7页
• 分类号: S831.2
• 字数: 5716字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.20200315-01

摘要

本研究旨在分析蛋鸡首次产蛋前后肝脏转录组中的可变剪切事件,探究鸡肝脏中可变剪切在不同生理状态下的类型、数目以及可能涉及的功能.应用生物信息学软件Hisat2对比蛋鸡肝脏转录组序列,利用rMATs软件进行可变剪切分析,利用DAVID在线分析工具对发现的差异可变剪切基因进行功能分析.结果 显示:鸡肝脏转录组中的5种可变剪切方式以外显子跳跃事件最多,是主要的可变剪切方式;对比产蛋前后2个时期的可变剪切事件发现,20个发生可变剪切的基因在这2个不同生理时期存在差异;基因功能富集分析发现,其中一些基因涉及细胞内吞的代谢途径,可能影响肝脏细胞通过胞吞作用对物质的吸收.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱芷葳	山西农业大学生命科学学院	54	223	7.0	13.0
2	李慧锋	山西农业大学生命科学学院	21	142	4.0	11.0
3	张臻	山西农业大学生命科学学院	2	3	1.0	1.0
4	石雄	山西农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
5	黄翔	山西农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
6	张玳维	山西农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
7	刘悦磊	山西农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0