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基于免疫基因组学的结肠腺癌患者预后风险模型的建立
基于免疫基因组学的结肠腺癌患者预后风险模型的建立
作者:
周玮
宋章法
曹高扬
王飞
章玮
陈力
陈恩更
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
结肠腺癌
免疫基因
癌症基因组图谱
预后
个体化诊疗
摘要:
目的 探索影响结肠腺癌患者预后的免疫基因,构建结肠腺癌患者的预后风险模型.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取结肠腺癌患者的RNA-seq数据及临床病例资料.根据组织样本分为肿瘤组与对照组,筛选出差异表达的免疫基因.通过Cox回归分析筛选出与结肠腺癌患者预后相关的免疫基因,并构建预后风险评分模型.计算每例结肠腺癌患者的风险评分,根据中位风险评分将其分为高风险组和低风险组,通过Kaplan-Meier分析及受试者工作特征(ROC)曲线对免疫基因预后风险模型的预测效能进行评价,并对免疫基因预后风险模型与免疫细胞浸润的相关性进行分析.结果 肿瘤组与对照组共存在220个差异表达的免疫基因,COX回归分析显示其中CXCL5(C-X-C motif chemokine ligand 5)、IGHV5-51(immunoglobulin heavy variable 5-51)、IGKV1-33(immunoglobulin kappa variable 1-33)、CHGA(chromogranin A)、UCN(urocortin)、VIP(vasoactive intestinal peptide)和NR3C2(nuclear receptor subfamily 3 group C member 2)等7个免疫基因与预后相关.构建的免疫基因预后风险评分模型为:风险评分(RS)=0.0050×CXCL5+0.0013×IGHV5-51+0.0221×IGKV1-33+0.0083×CHGA+0.3097×UCN+0.0551×VIP–0.2255×NR3C2.在结肠腺癌患者中,低风险组的总生存率高于高风险组(P<0.001),高风险组和低风险组的5年总生存率分别为49.4%和75.8%.ROC曲线显示AUC为0.741.免疫基因预后模型与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、树突细胞、巨噬细胞及自然杀伤细胞等免疫细胞浸润相关.结论 构建了结肠腺癌患者的免疫基因预后风险评分模型,系统评价和验证了该模型在结肠腺癌患者个体化治疗中的重要性,为寻找新的免疫治疗靶点提供了方向.
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文献信息
篇名
基于免疫基因组学的结肠腺癌患者预后风险模型的建立
来源期刊
解放军医学杂志
学科
医学
关键词
结肠腺癌
免疫基因
癌症基因组图谱
预后
个体化诊疗
年,卷(期)
2020,(9)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
935-939
页数
5页
分类号
R735.3
字数
语种
中文
DOI
10.11855/j.issn.0577-7402.2020.09.06
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作者信息
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宋章法
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周玮
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
解放军医学杂志
主办单位:
人民军医出版社
出版周期:
月刊
ISSN:
0577-7402
CN:
11-1056/R
开本:
大16开
出版地:
北京100036信箱188分箱
邮发代号:
2-74
创刊时间:
1964
语种:
chi
出版文献量(篇)
8116
总下载数(次)
11
总被引数(次)
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