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摘要:
目的 探索影响结肠腺癌患者预后的免疫基因,构建结肠腺癌患者的预后风险模型.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取结肠腺癌患者的RNA-seq数据及临床病例资料.根据组织样本分为肿瘤组与对照组,筛选出差异表达的免疫基因.通过Cox回归分析筛选出与结肠腺癌患者预后相关的免疫基因,并构建预后风险评分模型.计算每例结肠腺癌患者的风险评分,根据中位风险评分将其分为高风险组和低风险组,通过Kaplan-Meier分析及受试者工作特征(ROC)曲线对免疫基因预后风险模型的预测效能进行评价,并对免疫基因预后风险模型与免疫细胞浸润的相关性进行分析.结果 肿瘤组与对照组共存在220个差异表达的免疫基因,COX回归分析显示其中CXCL5(C-X-C motif chemokine ligand 5)、IGHV5-51(immunoglobulin heavy variable 5-51)、IGKV1-33(immunoglobulin kappa variable 1-33)、CHGA(chromogranin A)、UCN(urocortin)、VIP(vasoactive intestinal peptide)和NR3C2(nuclear receptor subfamily 3 group C member 2)等7个免疫基因与预后相关.构建的免疫基因预后风险评分模型为:风险评分(RS)=0.0050×CXCL5+0.0013×IGHV5-51+0.0221×IGKV1-33+0.0083×CHGA+0.3097×UCN+0.0551×VIP–0.2255×NR3C2.在结肠腺癌患者中,低风险组的总生存率高于高风险组(P<0.001),高风险组和低风险组的5年总生存率分别为49.4%和75.8%.ROC曲线显示AUC为0.741.免疫基因预后模型与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、树突细胞、巨噬细胞及自然杀伤细胞等免疫细胞浸润相关.结论 构建了结肠腺癌患者的免疫基因预后风险评分模型,系统评价和验证了该模型在结肠腺癌患者个体化治疗中的重要性,为寻找新的免疫治疗靶点提供了方向.
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文献信息
篇名 基于免疫基因组学的结肠腺癌患者预后风险模型的建立
来源期刊 解放军医学杂志 学科 医学
关键词 结肠腺癌 免疫基因 癌症基因组图谱 预后 个体化诊疗
年,卷(期) 2020,(9) 所属期刊栏目 临床研究
研究方向 页码范围 935-939
页数 5页 分类号 R735.3
字数 语种 中文
DOI 10.11855/j.issn.0577-7402.2020.09.06
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 陈力 76 360 10.0 14.0
2 王飞 137 1774 24.0 37.0
3 章玮 63 1679 18.0 40.0
4 宋章法 13 28 3.0 4.0
5 周玮 9 13 2.0 3.0
6 陈恩更 1 0 0.0 0.0
7 曹高扬 2 0 0.0 0.0
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11-1056/R
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