金边鲤皮肤黑色素合成及转运相关基因表达分析

• 作者: 严雪瑜 叶香尘 吕业坚 张桂姣 张盛 文衍红 甘宝江 邹辉 韦玲静
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 金边鲤 黑色素 差异表达基因 黑色素合成相关基因 心肌肾上腺素通路 色素沉着
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 水产科学
• 页码范围: 453-460
• 页数: 8页
• 分类号: S965.116
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.02.027

摘要

[目的]研究影响金边鲤皮肤色素沉着的关键基因及信号通路,揭示其皮肤颜色差异形成的原因,为金边鲤良种培育提供候选基因信息.[方法]基于突变型金边鲤黄色皮肤(Y组)和黑色皮肤(B组)及野生型金边鲤黑色皮肤(W组)的转录组测序数据,筛选分析获得部分共有差异表达基因,利用实时荧光定量PCR检测差异表达基因和黑色素合成相关基因的表达情况,并分析各基因间的相关性.[结果]依据转录组数据筛选获得ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3共5个来源于心肌肾上腺素信号通路及与细胞动力相关的基因;除ACT3基因外,其余4个基因(MYH2、TPM1、TPM2和TPM3)在Y组皮肤中的相对表达量均显著低于B组和W组(P<0.05,下同),与转录组分析的差异基因表达趋势一致.MC-1R、TYR、TYRP1和TYRP2等4个黑色素合成相关基因在金边鲤皮肤中的表达情况为:B组皮肤中MC-1R基因的相对表达量显著高于Y组和W组;TYR、TYRP1和TYRP2基因在3组皮肤中的相对表达量排序均为W组>B组>Y组,其中W组的相对表达量显著高于B组和Y组.相关性分析结果显示,MC-1R和TYR基因与ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3基因呈显著或极显著(P<0.01)正相关,而TYRP1和TYRP2基因与这5个差异表达基因均无显著相关性(P>0.05).[结论]ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3基因及其所在的心肌肾上腺素信号通路可能影响黑色素合成与运动,且与黑色素合成相关基因存在相关性,可作为金边鲤体色变异研究中的标记基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶香尘		20	14	2.0	2.0
2	张盛		21	26	3.0	3.0
3	韦玲静		13	5	1.0	2.0
4	吕业坚		21	72	5.0	7.0
5	邹辉		4	1	1.0	1.0
6	严雪瑜		5	2	1.0	1.0
7	甘宝江		4	0	0.0	0.0
8	文衍红		1	0	0.0	0.0