深度测序鉴定玉米雄穗花器官分化期响应干旱胁迫的miRNA和其靶基因

• 作者: 刘俊 李铭东 杨杰 梁晓玲 王业建 郗浩江 阿布来提·阿布拉 韩登旭
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 深度测序 干旱 雄穗 分化期 miRNA
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学·耕作栽培·生理生化
• 页码范围: 1373-1384
• 页数: 12页
• 分类号: S512
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2020.08.001

摘要

[目的]运用现代分子生物学及高通量测序技术,研究不同品种玉米雄穗花器官分化期响应干旱胁迫的差异miRNA和其靶基因,挖掘和鉴定与玉米发育相关的基因,分析其性状差异的信号通路及分子调控网络.[方法]以耐旱自交系"PHBA6"和干旱敏感自交系"吉63"为研究对象,应用深度测序技术进行miRNA文库构建,鉴定其差异表达的miRNA,对差异表达mi RNA及其靶基因进行功能注释、聚类分析及通路富集.[结果]鉴定了总共337种前体miRNA,其中包含289种已知的miRNA和48种新的miRNA.在3个文库,两个分组中共有155种差异表达miRNA.基于GO功能分类及遗传和基因组(KEGG)的功能富集显示,这些miRNA可能通过靶向一系列与胁迫相关的基因而在干旱胁迫中发挥作用.至少55个预测的靶基因进一步被60个miRNA调控.NAC,MYB和MAPK基因家族在干旱胁迫下评分最高,在植物抗旱中重要作用.一系列miRNA与这些排名靠前的基因相关,包括miR164、miR172、miR1520、miR6158、ghr-n24、ghr-n56等.[结论]miRNAs可能在玉米雄穗花器官分化期耐旱中发挥重要作用,miRNAs的筛选为分子辅助育种和转基因育种将提供新的靶标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁晓玲		35	388	9.0	19.0
2	李铭东		26	295	8.0	17.0
3	刘俊		10	28	3.0	4.0
4	阿布来提·阿布拉		24	80	6.0	8.0
5	韩登旭		23	70	6.0	7.0
6	杨杰		20	61	5.0	7.0
7	王业建		5	0	0.0	0.0
8	郗浩江		6	3	1.0	1.0