低磷胁迫柱花草差异表达基因分析研究

• 作者: 单贵莲 史亮涛 文亦芾 曾黎琼 罗富成 赵小雪 韩蓉蓉
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 柱花草 磷胁迫 同源性 cDNA-SRAP 差异表达
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 971-977
• 页数: 7页
• 分类号: S541
• 字数: 4711字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.05.017

摘要

研究柱花草在低磷条件下生长的分子机理和反应机制.采用 cDNA-SRAP 分子标记技术分离柱花草茎和叶在低磷胁迫下相关基因的差异表达片段,并对其进行生物信息学分析.结果表明,8 对引物组合共扩增出差异片段 195条,其中抑制型表达片段56条,诱导型表达片段92条,上调表达型差异片段36条,下调表达型片段11条,大小均在50～1000 bp之间.二次扩增后将特异性条带回收后进行测序,通过BLAST比对,共比对出14条差异片段的同源序列,其中 8个差异表达的核苷酸序列与已知功能基因(JCVI-FLLj-1K4未知 mRNA、NBS-LRR型抗病蛋白、ATP合成酶、醛固酮还原酶、叶绿体 RF2)有较高同源性,5 个序列与假定基因或预测基因(UPF0051 蛋白、蛋白酶启动子、SCEI结合酶、吲哚-3-丙酮酸盐单氧酶)同源性较高.本研究为筛选柱花草响应低磷胁迫的差异基因提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗富成	云南农业大学动物科学技术学院	84	612	14.0	20.0
2	文亦芾	云南农业大学动物科学技术学院	44	364	13.0	17.0
3	曾黎琼	云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所	26	239	9.0	15.0
4	单贵莲	云南农业大学动物科学技术学院	50	398	12.0	17.0
5	赵小雪	云南农业大学动物科学技术学院	2	0	0.0	0.0