铝胁迫下柱花草SSH文库构建及表达序列标签分析

• 作者: 易琼 李昆志 玉永雄 王奇峰 陈丽梅
• 来源期刊: 植物学报
• 关键词: 铝胁迫 cDNA文库 表达序列标签 柱花草 抑制消减杂交
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 679-688
• 分类号: Q94
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-3466.2010.06.005

摘要

柱花草栽培种热研2号(Stylosanthes guianensis'Reyan 2')对铝毒有较强的耐受性.为了鉴定其在铝胁迫下的诱导基因,利用抑制消减杂交(SSH)技术构建在300 μmol·L-1铝胁迫下正向cDNA文库.挑选插入片段大于300 bp的600个克隆进行测序,共得504条表达序列标签(EST).序列重复性分析表明,其中12.1%的EST只有1次重复,61.4%的EST有2-16次重复,重复出现次数较高的EST是细胞色素P450(53次,占10.5%)、病原诱导型胰蛋白酶抑制剂(44次,占8.7%)和衰老相关蛋白(37次,占7.3%).BLASTX分析显示,504条EST中有97种非冗余基因,其中包括46条功能已知基因和51条功能未知序列.46条功能已知EST中有30个为己报道铝胁迫相关基因,16个是新发现的铝胁迫相关基因.SSH cDNA文库提供的信息为阐明柱花草耐铝毒的分子机制提供了重要线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈丽梅	昆明理工大学生命科学与技术学院生物工程技术研究中心	99	642	14.0	18.0
2	李昆志	昆明理工大学生命科学与技术学院生物工程技术研究中心	73	471	13.0	16.0
3	玉永雄	西南大学动物科技学院	63	794	15.0	25.0
4	王奇峰	昆明理工大学生命科学与技术学院生物工程技术研究中心	2	24	2.0	2.0
5	易琼	昆明理工大学生命科学与技术学院生物工程技术研究中心	2	27	2.0	2.0