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基于iTRAQ技术筛选红榄李种子响应败育差异表达蛋白
基于iTRAQ技术筛选红榄李种子响应败育差异表达蛋白
作者:
张静文
张颖
李卫锦
袁长春
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
红榄李
濒危红树植物
败育机制
蛋白质组
摘要:
[目的]探索濒危红树植物红榄李败育种子的分子机制.[方法]借助iTRAQ定量蛋白质组学技术分析红榄李不同育性种子蛋白质组的表达差异.对质检合格的两个蛋白质组进行酶解,iTRAQ标记后进行高效液相色谱、质谱检测.利用Mascot软件进行蛋白质鉴定,通过iTRAQ定量寻找差异表达蛋白,并进行GO功能注释、KEGG代谢通路和蛋白互作分析,并通过实时荧光定量PCR对8个差异候选表达基因进行验证.[结果]红榄李种子蛋白质组共鉴定出2380个蛋白,其中差异表达蛋白448个,包括上调表达蛋白238个和下调表达蛋白210个.差异蛋白中的1.86%与生殖发育的生物学过程密切相关.GO分析表明,败育种子的上调蛋白主要参与到内质网蛋白的加工、RNA转运、RNA降解、囊泡运输中SNARE相互作用及mRNA调控等生物学过程.差异蛋白中的UGGT蛋白、HSP蛋白和囊泡相关膜蛋白可能在败育种子的发育过程中发挥重要调控作用.[结论]参与种子萌发和植物生长发育的转录因子出现不同程度的差异表达,可能是导致红榄李种子败育的直接或间接原因,研究结果为红榄李濒危机制和种质资源保护研究提供了科学支撑.
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文献信息
篇名
基于iTRAQ技术筛选红榄李种子响应败育差异表达蛋白
来源期刊
广东农业科学
学科
生物学
关键词
红榄李
濒危红树植物
败育机制
蛋白质组
年,卷(期)
2020,(7)
所属期刊栏目
园艺林学
研究方向
页码范围
68-78
页数
11页
分类号
Q341
字数
7313字
语种
中文
DOI
10.16768/j.issn.1004-874X.2020.07.009
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
袁长春
岭南师范学院生命科学与技术学院
31
78
5.0
6.0
2
李卫锦
岭南师范学院生命科学与技术学院
4
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0.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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红榄李
濒危红树植物
败育机制
蛋白质组
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广东农业科学
主办单位:
广东省农业科学院
华南农业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-874X
CN:
44-1267/S
开本:
大16开
出版地:
广州市五山广东省农科院内
邮发代号:
46-43
创刊时间:
1965
语种:
chi
出版文献量(篇)
14242
总下载数(次)
17
总被引数(次)
80868
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
海南省自然科学基金
英文译名:
官方网址:
项目类型:
学科类型:
期刊文献
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