基于iTRAQ技术筛选水稻根尖甲基汞胁迫响应差异蛋白及其生物信息学分析

• 作者: 仇广乐 刘琳 徐晓航 韦艳 龙水庭
• 来源期刊: 生态学杂志
• 关键词: iTRAQ 甲基汞胁迫 差异蛋白 水稻
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 方法与技术
• 页码范围: 2792-2801
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13292/j.1000-4890.202008.005

摘要

为了解水稻(Oryza sativaL.)对甲基汞胁迫响应的分子机制,采用两优302为实验材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ),联合液相色谱-串联质谱技术(LC-MS/MS),筛选水稻甲基汞胁迫下的根尖蛋白组差异表达蛋白,并结合生物信息学对差异蛋白进行分析.结果 表明,对照组与处理组共定量了3508个蛋白质,在差异倍数(foldchange)≥1.20或≤0.83,且P＜0.05条件下,筛选出88个差异蛋白,其中32个蛋白表达上调,56个蛋白表达下调,其中15个差异蛋白(包括类萌发素蛋白和脂氧合酶等12个已知蛋白和3个未知蛋白)具有与金属离子结合相关属性.基因本体(gene ontology,GO)分子功能提示,差异性蛋白主要涉及催化活性、结合和转运活性等生物学过程,京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析显示,差异蛋白显著富集于内质网蛋白加工、氧化磷酸化、淀粉与蔗糖代谢和苯丙素生物合成等代谢通路.研究结果为今后调控水稻中MeHg的吸收提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘琳	中国科学院地球化学研究所环境地球化学国家重点实验室	61	642	12.0	24.0
2	仇广乐	中国科学院地球化学研究所环境地球化学国家重点实验室	39	1090	23.0	32.0
3	徐晓航	中国科学院地球化学研究所环境地球化学国家重点实验室	3	1	1.0	1.0
4	韦艳	贵州医科大学公共卫生学院环境污染与疾病监控教育部重点实验室	15	31	3.0	5.0
5	龙水庭	贵州医科大学公共卫生学院环境污染与疾病监控教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0