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谷子BAS1基因生物信息学分析及其在干旱胁迫下的表达分析
谷子BAS1基因生物信息学分析及其在干旱胁迫下的表达分析
作者:
乔亚琪
李红英
武懿茂
段杰
温思钰
郭莎莎
原文服务方:
山西农业科学
谷子
BAS1
干旱胁迫
抗旱性
摘要:
BAS1是一种过氧化物酶,广泛存在于植物中,具有清除生物体内ROS、调节细胞内信号传导和分子伴侣的功能,在盐胁迫、光氧化、干旱及低温胁迫等方面起着重要的作用.通过生物信息学分析了谷子中的8个SiBAS1基因,并与近缘种高粱中SiBA S1基因进行亲缘关系比对.结果发现,高粱和谷子的SiBAS1基因家族同源性极高;对谷子SiBA S1基因进行启动子分析,结果发现,很多与干旱胁迫相关的响应元件包括干旱响应MYB结合位点MBS、低温响应元件LTR、热响应元件HSE、真菌诱导响应元件Box-W1、乙烯响应元件ERE、赤霉素响应元件P-box、水杨酸响应元件TCA-element和脱落酸响应元件ABRE等;通过对勾勾母鸡咀(GG,耐干旱品种)和晋汾16(JF16,干旱敏感品种)的SiBAS1基因转录组表达情况的分析发现,干旱胁迫下不同品种中同一SiBAS1基因的表达水平不同,且差异较大.其结果可为深入研究SiBA,S1基因与谷子抗旱性的关系提供依据,且有助于SiBA,S1基因对干旱的响应机制及作用机制的后续研究.
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文献信息
篇名
谷子BAS1基因生物信息学分析及其在干旱胁迫下的表达分析
来源期刊
山西农业科学
学科
关键词
谷子
BAS1
干旱胁迫
抗旱性
年,卷(期)
2017,(2)
所属期刊栏目
生物技术
研究方向
页码范围
151-155
页数
5页
分类号
S515
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1002-2481.2017.02.01
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
武懿茂
山西农业大学农学院
6
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2
郭莎莎
山西农业大学农学院
1
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1.0
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3
温思钰
山西农业大学农学院
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乔亚琪
山西农业大学农学院
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段杰
山西农业大学农学院
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节点文献
谷子
BAS1
干旱胁迫
抗旱性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
山西农业科学
主办单位:
山西省农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-2481
CN:
14-1113/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1961-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7094
总下载数(次)
0
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