甘薯盐胁迫响应基因IbMYB3的表达特征及生物信息学分析

• 作者: 李格 孟小庆 李宗芸 朱明库
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 生物信息学分析 表达特征 IbMYB3 甘薯 转录激活
• 年，卷（期）: 2021,（null）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 38-48
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11983/CBB19094

摘要

MYB转录因子具有多种生物学功能，在植物响应生物和非生物胁迫中发挥重要作用。该文从盐胁迫后的甘薯 (Ipomoea batatas)水培苗转录组数据(RNA-seq)中筛选出2个受盐胁迫显著上调表达的MYB基因，分别命名为IbMYB3和 IbMYB4。多种非生物胁迫和植物生长物质处理下的基因表达分析显示，IbMYB3受逆境诱导显著上调表达，暗示其可能参与 甘薯非生物胁迫响应。生物信息学分析表明，IbMYB3开放阅读框长度为1 059 bp，编码353个氨基酸残基，蛋白分子量为 39.41 kDa，理论等电点(PI)为5.26，为酸性带负电的亲水性蛋白。亚细胞定位结果表明，IbMYB3蛋白定位于细胞核，具有 较强的转录激活活性。上述结果表明，IbMYB3转录因子可能在甘薯非生物胁迫响应过程中发挥重要调控作用，研究结果为 进一步探明IbMYB3基因的功能奠定了基础。