甲基营养型芽胞杆菌WM7低温响应转录谱分析

• 作者: 刘宇帅 姜威 孟利强 张淑梅 曹旭 李晶 王玉霞
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 甲基营养型芽胞杆菌 低温 响应 转录谱分析
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1196-1204
• 页数: 9页
• 字数: 7725字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2020.06.1196

摘要

为从分子水平揭示甲基营养型芽胞杆菌WM7低温响应机制,采用高通量测序技术对低温和常温培养的菌体进行转录组测序分析,对部分差异表达显著基因进行RT-qPCR验证.结果 表明,共检测到2 029个差异表达基因,其中1 519个低温上调,510个低温下调.GO和KEGG分析显示,1 199个差异表达基因归属细胞组分、分子功能和生物过程3个部分,683个基因参与到225个代谢途径中,其中涉及基因最多的是磷酸戊糖途径、嘌呤和氨基酸合成途径.菌株低温响应主要与脂肪酸代谢、ABC转运体、转录调控、信号转导、碳氮代谢等途径相关.此外,检测到大量差异表达的未知功能基因,多个基因差异表达倍数均大于50倍.本研究从基因表达方面阐述了甲基营养型芽胞杆菌WM7低温响应机制,为全面揭示其低温生长机制奠定了理论基础,提供了基因信息.