猪圆环病毒2型感染人源细胞的转录组分析

• 作者: 任林柱 刘小花 刘晓慧 吉卫龙 张昕薇 徐鹏 欧阳婷
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 猪圆环病毒2型 转录组测序技术 抗病毒 实时定量 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 17-24
• 页数: 8页
• 分类号: R-33
• 字数: 5264字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7856.2020.06.003

摘要

目的 圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)能否感染人类细胞一直都是一个争论的话题.本研究通过转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术分析PCV2感染人源细胞后的差异表达基因及其相关的信号通路、生物学功能,以期为人源细胞对PCV2及其他病毒产生抗病毒效应的研究提供参考.方法 用PCV2感染HeLa细胞,然后进行RNA-seq技术分析,筛选与抗病毒反应相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并通过实时定量PCR进一步验证.结果 在感染PCV2的HeLa细胞中共注释到15402个UniGenes,其中有387个DEGs(包括267个上调基因和120个下调基因).对生物过程类DEGs进行GO富集和KEGG通路分析,发现富集基因要参与应激反应(97/291 DEGs)和免疫系统过程(80/291 DEGs),其中最显著两条途径的基因是NOD样受体信号途径(21/170 DEGs)和单纯疱疹病毒感染途径(22/170 DEGs)相关差异表达基因.结论 PCV2感染HeLa细胞之后,改变了细胞的表达谱,获得的DEGs及其功能注释信息有助于理解其抗病毒机制,对于了解PCV2感染人源细胞所产生的免疫反应及抗病毒效力提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任林柱	吉林大学动物科学学院	39	95	5.0	8.0
2	徐鹏	吉林大学动物科学学院	43	297	11.0	16.0
3	刘小花	吉林大学动物科学学院	2	0	0.0	0.0
4	张昕薇	吉林大学动物科学学院	2	0	0.0	0.0
5	吉卫龙	吉林大学动物科学学院	2	0	0.0	0.0
6	刘晓慧	吉林大学动物科学学院	7	83	4.0	7.0
7	欧阳婷	吉林大学动物科学学院	2	0	0.0	0.0