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有氧运动对人骨骼肌基因表达的影响
有氧运动对人骨骼肌基因表达的影响
作者:
刘立民
孙晓
王子璐
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
有氧运动
基因表达
蛋白质相互作用网络
生物信息学
摘要:
目的 通过生物信息学方法 分析有氧运动对人骨骼肌全基因组表达的影响及其促进健康的分子机制.方法从美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共基因芯片数据平台(GEO)下载GSE9103 mRNA基因芯片数据集,对股外侧肌活检样本进行骨骼肌转录谱分析,样本来源包括10例年轻久坐者、10例老年久坐者、10例年轻训练者和10例老年训练者.采用R语言"limma"函数包筛选差异表达基因(DEGs),设定阈值为logFC≥1且P<0.05.然后用DAVID数据库对靶基因进行GO和KEGG信号通路富集分析,进一步应用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络,应用cytoscape对模块中的基因的共表达关系进行可视化以及筛选关键基因.结果 年轻组和老年组共筛选出41个DEGs,GO分析显示DEGs生物学功能主要涉及细胞对饥饿的反应、乳酸代谢过程、细胞生长调节,KEGG分析显示DEGs主要和胰高血糖素信号通路、细胞紧密连接和单磷酸腺苷活化蛋白激酶(AMPK)信号通路有关.蛋白质相互作用网络筛选出THRSP、MYH8、MYH1、PDK4、IGFN1、CALML6、PRKAG3、G0S2、ACTN3和FOXO1共10个关键基因.结论 生物信息学技术能有效筛选和分析有氧运动与久坐者相关DEGs,为进一步探讨有氧运动对机体的作用机制及靶点提供思路.
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文献信息
篇名
有氧运动对人骨骼肌基因表达的影响
来源期刊
中国医科大学学报
学科
医学
关键词
有氧运动
基因表达
蛋白质相互作用网络
生物信息学
年,卷(期)
2020,(6)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
556-560
页数
5页
分类号
R455
字数
2225字
语种
中文
DOI
10.12007/j.issn.0258-4646.2020.06.017
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
刘立民
中国医科大学附属盛京医院药学部
34
141
8.0
10.0
2
孙晓
中国医科大学体育部
14
65
5.0
7.0
3
王子璐
中国医科大学体育部
2
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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有氧运动
基因表达
蛋白质相互作用网络
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国医科大学学报
主办单位:
中国医科大学
出版周期:
月刊
ISSN:
0258-4646
CN:
21-1227/R
开本:
大16开
出版地:
沈阳市和平区北二马路92号
邮发代号:
8-175
创刊时间:
1951
语种:
chi
出版文献量(篇)
6544
总下载数(次)
2
总被引数(次)
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