锌指蛋白521在肾母细胞瘤的表达及转录调控预测研究

• 作者: 胡师华 韦康来
• 来源期刊: 岭南现代临床外科
• 学科: 医学
• 关键词: 锌指蛋白521 转录因子 肾母细胞瘤 诊断性meta分析 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 论著与临床研究
• 页码范围: 774-783
• 页数: 10页
• 分类号: R737.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-976X.2020.06.019

摘要

目的 探究锌指蛋白521(ZNF521)在肾母细胞瘤中的表达和诊断价值,预测ZNF521相关基因及靶基因,分析相关功能及调控机制.方法 基于TARGET、GTEx和GEO数据库中RNA-seq数据,筛选肾母细胞瘤差异基因,计算ZNF521在肾母细胞瘤中的表达并使用诊断Meta分析评估诊断效能.使用Pearson相关分析筛选出ZNF521的相关基因,进行富集分析.基于Cistrome DB下载ZNF521的ChIP-Seq数据预测ZNF521潜在靶基因,将肾母细胞瘤差异基因、ZNF521相关基因以及潜在靶基因取交集作为最佳潜在靶基因,构建蛋白互作网络进行功能注释.结果 共纳入185例肾母细胞瘤组织和69例非肿瘤肾组织的RNA-seq数据,ZNF521在肿瘤组织中高表达(SMD=3.385,95％CI:1.024～5.747,P=0.005),SROC曲线下面积为0.990(95％CI:0.970～0.990).富集分析显示,ZNF521相关基因显著富集的功能和疾病包括DNA复制、细胞周期、肾脏发育、泌尿系统癌症.最终获得101个最佳潜在靶基因,其中FGFR1涉及细胞代谢、细胞分裂、胚胎发育等多个生物过程,并且在蛋白互作网络中与存在相似功能的IGF2、EZH2存在潜在互作关系.结论ZNF521在肾母细胞瘤样本中高表达,ZNF521相关基因及最佳预测靶基因与肾母细胞瘤密切相关,可能作为临床上肾母细胞瘤诊断治疗的潜在靶点.