Curcin和curcin C与腺嘌呤互作位点的比较分析

• 作者: 吴朋 徐莺 邓聿杉 陈放
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 麻疯树 核糖体失活蛋白 结构预测 分子对接 腺嘌呤
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 1186-1192
• 页数: 7页
• 分类号: Q518.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2020.06.025

摘要

麻疯树核糖体失活蛋白curcin和curcin C均具有抗肿瘤活性,但后者的活性水平显著高于前者,为了探索造成这一差异的结构基础,本文采用在线的同源建模预测软件SWISS-MODEL,对两种麻疯树核糖体失活蛋白curcin、curcin C的三维结构模型进行预测,采用SYBYL对预测模型进行能量最小化优化,采用PROCHECK、VERIFY 3D和ERRAT软件对优化前后的模型进行质量评估,随后采用AutoDock软件将预测的模型与腺嘌呤进行分子对接分析.结果显示,两种蛋白采用与Ricin A类似的方式与腺嘌呤相互作用,但在相互作用的氨基酸残基种类、数量以及形成的氢键和疏水相互作用上还是存在差异,其中,curcin C与腺嘌呤具有最强的结合能力,curcin则最低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈放		310	4897	34.0	55.0
2	徐莺		103	1016	18.0	27.0
3	吴朋		5	12	2.0	3.0
4	邓聿杉		1	0	0.0	0.0