lncRNA MRAK048635_P1对血管平滑肌细胞miRNA的调控作用

• 作者: 方根强 祁佳 赵仙先 陈书艳 黄黎亚
• 来源期刊: 医学研究杂志
• 学科: 医学
• 关键词: lncRNA MRAK048635_P1 miRNAs 靶基因 VSMC 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 58-64
• 页数: 7页
• 分类号: R318.04
• 字数: 4764字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2020.05.013

摘要

目的 旨在预测VSMC细胞中MRAK048635_P1参与调控的miRNAs并对其靶基因进行系统的生物学分析.方法 利用特异性siRNA敲减来自正常大鼠胸主动脉VSMC中的MRAK048635_P1基因.整体层次聚类分析用于判断各组中差异表达的miRNAs.应用miRanda、PITA和RNAhybrid预测差异表达的miRNAs的靶基因并取其交集作为分析的基因集合,分别进行gene ontology(GO)中的细胞组分(cellular component,CC)、分子功能(molecular function,MF)和生物学过程(biological process,BP)分析.最后,对差异表达的miRNAs的靶基因进行kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)生物通路富集分析.结果 siRNA介导VSMC细胞MRAK048635_P1下调后,共有12个差异表达的miRNAs,其中上调和下调的miRNAs个数分别为5和7.差异表达的miRNAs的靶基因共5066个.GO富集分析发现其中的302个基因主要富集于VSMC分化(如G pro-tein-coupled estrogen receptor 1,Gper1),血管内皮迁移的负调控、心血管系统发育、信号受体活性、核染色质和蛋白结合以及免疫应答等.KE GG富集发现这些靶基因显著富集于轴突导向、昼夜节律、N-糖基生物合成、内吞蛋白加工、内质网矿物吸收、鞘脂代谢和核糖体生物合成等相关通路(P<0.05).结论 在VSMC中,MRAK048635_P1可能通过与多种miRNAs相互作用而参与相关靶基因的调控,对于MRAK048635_P1的深入研究有助于揭示VSMC在高血压病中的作用机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵仙先	中国人民解放军海军军医大学附属长海医院心血管内科	3	3	1.0	1.0