基于Oncomine和TCGA数据库分析GABRE在结肠癌组织中的表达及生物学意义

• 作者: 杨佳妮 白怡冰 崔瑛 连洁 吴峰 张艳桥
• 来源期刊: 中国肿瘤生物治疗杂志
• 学科: 医学
• 关键词: GABRE基因 结肠癌 Oncomine数据库 TCGA数据库 预后 生物标志物
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 1399-1405
• 页数: 7页
• 分类号: R735.3|R730.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3872/j.issn.1007-385x.2020.12.014

摘要

目的:通过挖掘Oncomine和TCGA等数据库信息分析GABRE基因在结肠癌中的表达及其生物学意义.方法:利用Oncomine、TCGA数据库分析GABRE基因在结肠癌组织中的表达及其与患者预后的关系;运用TargetScan、starBase、mirDIP和miRWalk寻找靶向GABRE基因的上游miRNA,并分析其在结肠癌中的表达及其与预后的关系.进一步利用LinkedOmics数据库寻找GABRE共表达基因,并进行GO富集分析及KEGG通路分析.结果:数据库数据分析显示,GABRE在结肠癌组织中高表达且预示着患者预后较差(均P＜0.05).韦恩图显示,hsa-miR-370-3p靶向GABRE,并在正常组织中的表达显著升高(P＜0.01).GABRE基因与OGT、FAM156A基因等表达呈正相关(P＜0.05),与ATP5A1、MPDU1基因等表达呈负相关(P＜0.05).GO生物功能及KEGG通路富集分析提示,GABRE基因可能参与蛋白脱烷基化和周期蛋白依赖性蛋白激酶活性调节等生物学过程,并在牛磺酸代谢和NF-κB信号通路等方面富集.结论:GABRE基因在结肠癌患者中高表达且预示着患者预后较差,提示该基因是结肠癌的诊断和治疗的潜在新靶点.