基于TCGA数据库对RUVBL1基因在结肠腺癌中的诊断和预后价值研究

• 作者: 廖锡文 闫岭 阮国添 马辉 龚艺贞
• 来源期刊: 结直肠肛门外科
• 关键词: 结肠腺癌 TCGA数据库 RUVBL1基因
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 论著·基础研究
• 页码范围: 269-273
• 页数: 5页
• 分类号: R735.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.19668/j.cnki.issn1674-0491.2019.03.005

摘要

目的 通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中结肠腺癌(colon adenocarcinoma,COAD)患者癌组织和癌旁正常结肠组织的RUVBL1基因RNA测序数据进行分析,研究其在结肠腺癌中的诊断和预后的价值.方法 从TCGA数据库下载COAD的RNA测序数据集及临床资料,绘制散点图比较RUVBL1基因在COAD癌组织和癌旁正常组织中的表达差异;绘制ROC曲线研究RUVBL1基因表达对COAD的诊断价值;Kaplan-Meier法绘制生存曲线分析RUVBL1基因表达与COAD总体生存时间的关系;采用单因素与多因素Cox回归模型分析临床参数与COAD临床预后的关系,其中风险比(Hazard Ratio,HR)与95％置信区间(95％Confidence Interval,95％CI)用于量化评估临床参数与预后的相关性.结果 RUVBL1基因在癌组织中的表达量为(2486.000±39.590),高于其在癌旁正常结肠组织中的表达量(966.300±35.450),差异有统计学意义(P<0.001);ROC曲线显示RUVBL1基因对COAD有较高的诊断价值(AUC=0.972,95％CI:0.958～0.986);Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示RU?VBL1基因表达与总生存时间相关,低表达患者总体生存时间优于高表达患者(P=0.027);单因素分析结果显示患者性别、年龄与患者的预后无关(Log-rank P=0.545,0.114),而肿瘤TNM分期(P<0.001)、RUVBL1基因表达与COAD预后相关(Crude P=0.028;Crude HR=1.587,95％CI:1.051～2.397).进一步进行校正肿瘤TNM分期的Cox多因素分析,结果显示RUVBL1基因高表达是影响COAD预后的独立危险因素(Adjusted P=0.038;Adjusted HR=1.565;95％CI:1.026～2.386).结论 RUVBL1基因可能是COAD诊断和预测预后潜在的生物学标记物,未来需要更进一步研究来验证其价值.