基于TCGA数据库分析TET1在肺腺癌的表达及其相关分析

• 作者: 杨勇 马晨阳
• 来源期刊: 浙江临床医学
• 关键词: 肺腺癌 TCGA TET1 肿瘤标志物
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 731-734
• 页数: 4页
• 语种: 中文

摘要

目的? 探析TET1对肺腺癌(LUAD)的调控机制和作为早期肿瘤标志物的可能性,并对其可能通路进行预测.方法? 基于TCGA和GEO数据库,通过相关分析软件对TET1在LUAD的表达预后及其机制进行分析、总结、归纳,尝试探索TET1在LUAD的应用前景.结果? TET1mRNA表达水平在肺腺癌中升高,且与总生存预后显著相关,为高危因素(HR>1,P<0.05),与临床常见LUAD驱动基因EGFR、TP53相关性小,随后相关性和PPI分析说明其与EGFR、TP53无明显相关,可作为独立驱动基因对LUAD发生发展起作用,并确认其共表达基因所处细胞组分,所执行生物学功能及分子功能的富集,认为TET1共表达基因主要通过转录调控方面调节肿瘤发生发展.KEGG-GO分析出通路?HSA-212165、HSA-74160、HSA-5334118与TET1基因相关,为后续通路研究提供参考.结论? TET1通过遗传转录调控方面调节LUAD的发生发展,其在早期诊断和判断预后方面有其独特的优势,可确定TET1基因可作为LUAD预后评估的重要分子标志物.