基于TCGA数据库肺腺癌RNAs构建ceRNA网络的综合分析

• 作者: 唐怀慧 杨青山 王忠帅 邵茜茜
• 来源期刊: 医学信息
• 学科: 医学
• 关键词: TCGA 肺腺癌 ceRNA网络 预后
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 90-93
• 页数: 4页
• 分类号: R734.2
• 字数: 2412字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-1959.2020.07.025

摘要

目的 基于TCGA数据库挖掘肺腺癌差异表达的RNAs,通过ceRNA网络的综合分析并预测其与患者预后的相关性.方法 利用TCGA数据库下载肺腺癌的表达数据,使用R软件"edgeR"包初步筛选差异表达的RNAs,进一步构建肺腺癌的lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络,对ceRNA网络中的mRNAs进行了K-M生存分析.结果 筛选的差异表达的RNAs中有3个mRNA(ANLN、IGFBP1、TFAP2A)、4个lncRNA(AC015923.1、FGF12-AS2、LINC00211、MED4-AS1)、2个miRNA(hsa-mir-31、hsa-mir-490),均与预后相关.其中hsa-mir-31预后价值最高(P<0.001),LINC00461和has-mir-139为关键节点的ceRNA调控网络.结论 本次筛选出的3个mRNA、4个lncRNA和2个miRNA可作为肺腺癌的新候选预后因子,且LINC00461和has-mir-139是肺腺癌ceRNA中两个重要的调控网络节点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王忠帅		3	11	1.0	3.0
2	杨青山		2	0	0.0	0.0
3	唐怀慧		1	0	0.0	0.0
4	邵茜茜		1	0	0.0	0.0