基于TCGA数据库的乳腺癌进程关键 基因系统筛选和鉴定

• 作者: 冯旭 张洪磊 柯浩 赵丽敏
• 来源期刊: 郑州大学学报（理学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 转录组 TCGA数据库 SGOL1
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 页码范围: 93-99
• 页数: 7页
• 分类号: R857.3
• 字数: 4183字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13705/j.issn.1671-6841.2017121

摘要

利用TCGA数据库收集的乳腺癌转录组数据和病人临床信息,分析基因表达与乳腺癌临床病理学参数的相关性及其对预后的影响,同时结合表达差异分析筛选出与乳腺癌进程密切相关的7个候选基因(UBE2T、RRM2、SGOL1、ERCC6L、CCNE1、HMGB3和SPDYC).通过基因功能注释检索确定SGOL1作为实验验证的候选基因.实验结果表明在乳腺癌细胞系MDA-MB-231中敲降SGOL1能显著抑制细胞生长,细胞周期被阻滞在G2/M期.上述结果表明SGOL1在乳腺癌进程中具有重要作用,同时也说明该生物信息结合实验的筛选方法可以加速肿瘤关键基因的筛选和鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯旭	昆明理工大学生命科学与技术学院	2	8	2.0	2.0
2	赵丽敏	中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室	1	2	1.0	1.0
6	柯浩	中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室	1	2	1.0	1.0
10	张洪磊	中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室	1	2	1.0	1.0