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基于平行反应监测验证技术分析绵羊胚胎骨骼肌蛋白质组数据
基于平行反应监测验证技术分析绵羊胚胎骨骼肌蛋白质组数据
作者:
尚明玉
张莉
王欣悦
石田培
赵志达
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
绵羊
胚胎骨骼肌
平行反应监测
蛋白质组学
摘要:
旨在对绵羊胚胎骨骼肌蛋白质组学数据进行分析,为阐明绵羊胚胎骨骼肌生长发育机制奠定基础.前期试验应用串联质谱定量法(tandem mass tag,TMT)对成年中国美利奴绵羊妊娠第85(D85)、105(D105)和135天(D135)的胚胎背最长肌进行蛋白质定量,并对D85/D105、D105/D135和D85/D1353个比较组进行分析.本试验在此基础上,利用KEGG和平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)等数据分析方法对3个比较组绵羊胚胎骨骼肌上、下调差异丰度蛋白质进行分析和验证,并对候选蛋白质进行生物信息学分析.本研究对肌纤维成熟分化标志性蛋白肌球蛋白重链(myosin-2 isoform X2,MYH)进行PRM靶向定量验证,结果表明,其变化趋势与绵羊胚胎肌纤维成熟分化趋势相符.本研究对上调差异丰度蛋白和下调差异丰度蛋白的KEGG分析结果表明,D105/D85比较组中上调差异丰度蛋白质显著富集于胰岛素等信号通路,D135/D105和D135/D85比较组中下调差异丰度蛋白质显著富集于DNA复制和蛋白质消化吸收等信号通路.与肌肉发育相关的cAMP依赖性蛋白激酶A催化亚基α(PRKACA)和葡萄糖转运蛋白成员4(GLUT4)蛋白均显著富集于胰岛素信号通路中,生物信息学分析显示,这两个蛋白质的理论分子量分别为121.73和20.64 ku,分别有147、12个带正电荷的氨基酸残基和135、12个带负电荷的氨基酸残基;理论等电点分别为8.81和6.54;亲水性平均系数分别为-0.408和0.811;PRKACA蛋白无N端糖基化位点,有45个磷酸化位点;GLUT4蛋白有1个N端糖基化位点,25个磷酸化位点;PRKACA蛋白三级结构与CAMP-2依赖蛋白激酶a嵌合融合的晶体结构相似度为85%,GLUT4蛋白三级结构与人葡萄糖转运蛋白GLUT1的相似性为78%.本研究表明,PRM定量验证趋势与绵羊胚胎肌纤维成熟分化趋势相符,PRKACA和GLUT4蛋白具有丰富的磷酸化修饰位点,并参与胰岛素信号通路调控,是重要的候选蛋白.
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抗阻运动
蛋白质补充
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骨骼肌衰减综合征
运动量
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合成速率
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肌萎缩侧索硬化症患者骨骼肌蛋白质组学初步研究
肌萎缩侧索硬化症
骨骼肌
蛋白质组学
双向电泳
腺苷酸活化蛋白激酶与骨骼肌蛋白质降解
腺苷酸活化蛋白激酶
骨骼肌
代谢
运动
结构
内容分析
文献信息
引文网络
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相关基金
期刊文献
内容分析
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关键词热度
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文献信息
篇名
基于平行反应监测验证技术分析绵羊胚胎骨骼肌蛋白质组数据
来源期刊
畜牧兽医学报
学科
农学
关键词
绵羊
胚胎骨骼肌
平行反应监测
蛋白质组学
年,卷(期)
2020,(7)
所属期刊栏目
遗传育种
研究方向
页码范围
1587-1596
页数
10页
分类号
S826.2
字数
4755字
语种
中文
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2020.07.011
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张莉
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
190
1101
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26.0
2
石田培
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
7
6
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王欣悦
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
7
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赵志达
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
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中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
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胚胎骨骼肌
平行反应监测
蛋白质组学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
畜牧兽医学报
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0366-6964
CN:
11-1985/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号
邮发代号:
82-453
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
5501
总下载数(次)
6
总被引数(次)
62883
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