猪流行性腹泻病毒S2基因的克隆与遗传进化分析

• 作者: 刘运超 徐引弟 李海利 焦文强 王克领 王治方 邢广旭
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 S2基因 克隆 进化分析 阳性检出率
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·蚕桑水产
• 页码范围: 106-110
• 页数: 5页
• 分类号: S852.65+1
• 字数: 2204字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2020.02.019

摘要

为了解猪流行性腹泻病毒(PEDV)新流行毒株的遗传变异情况,本研究对2014—2018年间采集的205份PEDV疑似阳性样品进行RT-PCR检测、扩增PEDV S2基因并进行遗传转化分析.RT-PCR结果显示,205份疑似阳性样品中有191份扩增出单一条带,片段大小为1887 bp,符合S2基因的扩增预期.试验样品阳性检出率为93.17％.测序分析表明,试验共获得25株S2基因序列,与参考毒株之间核苷酸的同源性为94.3％～99.6％,氨基酸的同源性为86.4％～96.2％.遗传进化分析结果显示,试验得到的PEDV毒株分属于G1、G2亚群.本研究为PEDV防控以及疫苗毒株筛选奠定基础.