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摘要:
目的 通过对肿瘤芯片数据库(Oncomine)和生存分析数据库(Kaplan-Meier Plotter)和蛋白-蛋白相互作用数据库(STRING)进行数据挖掘,探讨干扰素刺激基因15(ISG15)在原发性肝癌中的表达情况及其与患者预后的关系.方法 分别对Oncomine数据库、Kaplan-Meier Plotter数据库和STRING数据库进行肝癌中ISG15基因表达的相关研究检索,探讨ISG15基因在肝癌组织和对应正常组织中的表达情况,绘制ISG15基因表达与肝癌患者总体生存时间的生存曲线.构建ISG15相互作用蛋白网络树状图,并对ISG15及其相关蛋白基因进行功能富集分析.结果 通过检索Oncomine数据库发现,有5个研究结果显示肝癌组织中ISG15呈高表达(包括细胞系),有2项研究结果显示ISG15在肝癌组织中的表达水平显著高于正常肝组织(P <0.05).通过对Kaplan-Meier Plotter数据库进行检索分析发现,在病毒性肝炎、饮酒的肝癌患者中,ISG15高表达患者的总体生存时间明显短于ISG15低表达患者(P<0.05).通过STRING数据库搜索ISG15基因相关蛋白发现,ISG15基因相互作用蛋白有10种;生物过程富集分析结果显示,上述蛋白主要富集在病毒防御和病毒基因组复制的负调控通路.结论 ISG15在肝癌组织中高表达,且可能与病毒性肝炎、酒精性肝癌患者的预后密切相关.
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文献信息
篇名 干扰素刺激基因15在原发性肝癌中的表达及与患者预后的关系
来源期刊 内科 学科 医学
关键词 原发性肝癌 干扰素刺激基因15 Oncomine Kaplan-Meier Plotter STRING
年,卷(期) 2020,(6) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 676-679
页数 4页 分类号 R735.7
字数 语种 中文
DOI 10.16121/j.cnki.cn45-1347/r.2020.06.12
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研究主题发展历程
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原发性肝癌
干扰素刺激基因15
Oncomine
Kaplan-Meier Plotter
STRING
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内科
双月刊
1673-7768
45-1347/R
大16开
广西省南宁市东葛路20-7号
48-37
2006
chi
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19973
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