影响前列腺癌风险的关键基因识别

• 作者: 华琳 李熹阳 谷明宇
• 来源期刊: 医学信息
• 学科: 医学
• 关键词: 前列腺癌 基因差异表达分析 生物信息学 富集分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 80-85
• 页数: 6页
• 分类号: R737.25
• 字数: 4085字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-1959.2020.02.022

摘要

目的 基于TCGA数据库筛选影响前列腺癌(PCa)风险水平的关键基因,并建立PCa患者生存风险预测模型.方法 从TCGA数据库下载PCa患者基因表达数据及相关临床数据,通过前期研究初步筛选基因,并将患者分为高、低风险两类;对基因进行差异表达分析和GO和KEGG通路富集分析,筛选相关基因和信号通路;对差异表达基因进行蛋白互作网络分析,标记出关键基因;将关键基因的表达数据与PCa患者生存时间纳入Cox回归分析,建立生存风险预测模型.结果 前期研究得到620个基因,高风险患者234例,低风险患者285例;差异表达分析获得30个基因,主要分子功能(MF)为:受体结合和生长因子活动,生物学过程(BP)主要为细胞-细胞信号传导、细胞增殖的积极调节、血管生成的调节和细胞表面受体信号通路,细胞组分(CC)主要定位于细胞外区域,而KEGG信号通路为细胞因子-细胞因子受体相互作用;蛋白互作分析中共7个基因有相互作用,Cytoscape筛选出5个关键基因:PHYHIPL、CNTFR、GFRA1、EDN3和PROK1.结论 通过本研究识别的影响PCa预后的关键基因,发现潜在的PCa风险靶点,可能为PCa的治疗和预后提供帮助.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	华琳	首都医科大学生物医学工程学院	100	538	11.0	21.0
2	李熹阳	首都医科大学公共卫生学院	1	0	0.0	0.0
3	谷明宇	首都医科大学公共卫生学院	1	0	0.0	0.0