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摘要:
目的:探讨同源盒基因D3( HOXD3)在胶质瘤中的表达及其生物学功能。 方法:回顾性收集中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)和癌症基因组图谱(TCGA)中1001例胶质瘤患者的临床资料及转录组数据,采用单因素方差分析比较不同病理分级胶质瘤间 HOXD3表达水平的差异;并根据 HOXD3表达水平的均值,分别将CGGA和TCGA数据库中的患者分为 HOXD3低表达组与 HOXD3高表达组,采用Kaplan-Meier生存分析比较 HOXD3高表达组与 HOXD3低表达组间生存期的差异,采用单因素回归分析及多因素Cox回归分析明确 HOXD3对胶质瘤患者预后的影响;最后通过基因本体(GO)分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析以及基因富集分析(GSEA)探究 HOXD3可能参与的信号通路,并采用Pearson相关分析法分析 HOXD3与其他基因表达的相关性。 结果:(1) HOXD3的表达水平随着胶质瘤病理分级的升高逐渐升高(CGGA数据中Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ级胶质瘤的表达水平分别为0.737±0.085、1.323±0.125、1.652±0.083;TCGA数据中Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ级胶质瘤的表达水平分别为0.082±0.008、0.177±0.014、0.259±0.016),不同病理分级间 HOXD3表达水平差异均有统计学意义( P<0.05)。(2)与 HOXD3低表达组相比, HOXD3高表达组患者的生存期明显缩短,差异有统计学意义( P<0.05)。CGGA数据显示 HOXD3表达水平( HR=1.348, 95%CI:1.171~1.552, P=0.000)、肿瘤病理分级和异柠檬酸脱氢酶1( IDH1)突变状态为胶质瘤患者预后的独立影响因素;TCGA数据显示 HOXD3表达水平( HR=2.147, 95%CI:1.252~3.681, P=0.005)、年龄、肿瘤病理分级和 IDH1突变状态为胶质瘤患者预后的独立影响因素。(3)GO分析、KEGG分析和GSEA结果均提示 HOXD3参与细胞周期的调控;Pearson相关分析发现 HOXD3的表达水平与多种细胞周期调控基因的表达水平呈明显正相关关系( P<0.05)。 结论:HOXD3为胶质瘤预后的独立影响因素,其生物学功能与胶质瘤细胞的周期调控相关。
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文献信息
篇名 同源盒基因D3在胶质瘤中的表达及其生物学功能分析
来源期刊 中华神经医学杂志 学科
关键词 神经胶质瘤 同源盒基因D3 预后 细胞周期
年,卷(期) 2020,(10) 所属期刊栏目 临床研究
研究方向 页码范围 988-994
页数 7页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.cn115354-20200606-00455
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刘献志 郑州大学第一附属医院/郑州大学第一临床学院 145 409 10.0 14.0
2 张振宇 郑州大学第一附属医院/郑州大学第一临床学院 25 50 3.0 6.0
3 赵亚鹏 郑州大学第一附属医院/郑州大学第一临床学院 5 7 2.0 2.0
4 王艳敏 郑州大学第一附属医院/郑州大学第一临床学院 8 7 1.0 2.0
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神经胶质瘤
同源盒基因D3
预后
细胞周期
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中华神经医学杂志
月刊
1671-8925
11-5354/R
大16开
广州市海珠区工业大道中253号珠江医院
46-251
2002
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