乙酰乳酸合成酶抗性突变的分子动力学模拟

• 作者: 罗青 赵奇 邓培渊 郭运宏 陈丽培
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 乙酰乳酸合成酶 定点突变 苯磺隆 分子动力学模拟
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 植物保护·农业气象
• 页码范围: 2167-2173
• 页数: 7页
• 分类号: S482.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.09.015

摘要

[目的]研究乙酰乳酸合成酶(ALS)及Pro197Ser(P197S)突变体与抑制剂苯磺隆(TBM)的分子结合模式,阐明其分子作用机制,为基于ALS的新型除草剂研发和杂草防控等提供参考.[方法]运用AutoDock 4.2进行ALS和P197S与TBM多构象对接,采用YASARA平台进行分子动力学模拟,利用MMPBSA.py模块计算ALS_TBM和P197S_TBM体系复合物的结合自由能,并以Amber 12分析关键氨基酸、结合模式和相互作用力.[结果]P197S_TBM突变体系接触氨基酸残基数量增多,接触位点偏集中于C端,氢键数量更多、键长更短;P197S_TBM体系的均方根偏差(RMSD)较低,250～320位氨基酸残基区域和350～430位氨基酸残基区域均方根涨落(RMSF)下降明显;P197S_TBM体系的结合P197S自由能更低,亲和力贡献大的氨基酸残基数量增加.[结论]P197S突变引起ALS与TBM结合位点和结合模式发生变化,接触氨基酸残基和氢键增多,促结合能量值增加,突变体系更稳定.417～423位氨基酸残基在ALS与TBM结合过程中是较集中贡献能量的氨基酸团.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗青		31	103	5.0	9.0
2	邓培渊		14	31	2.0	5.0
3	赵奇		39	68	5.0	5.0
4	陈丽培		19	66	4.0	7.0
5	郭运宏		1	0	0.0	0.0