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摘要:
目的 研究头颈部鳞癌(HNSCC)的自噬基因调控及生物标志物FK506结合蛋白1A(FKBP1A)在HNSCC中的表达及影响.方法 利用肿瘤基因组图谱(TCGA)分析HNSCC组织与正常黏膜组织的基因表达差异;利用DAVID生物信息学资源库进行HNSCC中差异明显的自噬相关基因功能注释与富集的研究,利用单因素与多因素COX回归分析寻找对于TCGA中HNSCC患者预后有意义的基因;利用基因表达综合数据库(GEO)验证目的基因与HNSCC患者的预后,利用Kaplan-Meier Plotter分析自噬相关基因与HNSCC患者预后相关性;利用免疫组化实验及实时荧光定量PCR检测对比临床HNSCC组织样本与癌旁样本中FKBP1A的表达量.结果 相比于正常组织,HNSCC组织共有38个自噬相关基因(其中28个上调,10个下调)发生显著的变化.这些差异基因主要参与人体中生物过程(BP),细胞成分(CC)和分子功能(MF)部分中的自噬相关通路.单因素与多因素Cox回归分析发现有18个自噬相关基因在TCGA数据库中与HNSCC患者的预后相关.将其中的高风险基因在GEO数据库中进行验证,发现FKBP1A与HNSCC患者预后紧密相关,免疫组化与实时荧光定量PCR显示FK-BP1A在HNSCC患者中的表达高于对应的癌旁组织,且与HNSCC的分期紧密相关.结论 本研究综合多种生物信息学手段,揭示了参与HNSCC发生发展的自噬相关基因的作用,筛选出与HNSCC患者预后紧密相关的生物分子标志物FKBP1A,为HNSCC的发病机制及潜在治疗靶点发现提供理论依据.
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文献信息
篇名 自噬基因FKBP1A在头颈部鳞癌中的表达及其作用
来源期刊 中国医师杂志 学科
关键词 头颈部肿瘤 癌,鳞状细胞 自噬相关基因 FKBP1A
年,卷(期) 2020,(8) 所属期刊栏目 专题研究·头颈肿瘤诊疗
研究方向 页码范围 1130-1134,1138
页数 6页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.cn431274-20190513-00559
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 华清泉 武汉大学人民医院耳鼻咽喉头颈外科 75 324 9.0 13.0
2 王洁 武汉大学人民医院耳鼻咽喉头颈外科 33 136 5.0 11.0
3 谢章弘 武汉大学人民医院耳鼻咽喉头颈外科 2 0 0.0 0.0
4 曾峰 武汉大学人民医院耳鼻咽喉头颈外科 3 18 1.0 3.0
5 景水力 武汉大学人民医院耳鼻咽喉头颈外科 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
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头颈部肿瘤
癌,鳞状细胞
自噬相关基因
FKBP1A
研究起点
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研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国医师杂志
月刊
1008-1372
43-1274/R
大16开
长沙市芙蓉区新军路43号中国医师杂志社518办公室
42-141
1995
chi
出版文献量(篇)
18756
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