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基于Hiseq测序分析沉香不同层的细菌分布特征
基于Hiseq测序分析沉香不同层的细菌分布特征
作者:
刘娟
周良云
张香
杨全
袁媛
高佳琪
黄璐琦
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
白木香
沉香不同分层
细菌物种多样性
细菌群落结构
摘要:
为探究沉香不同层之间细菌群落结构与多样性,该文采用Hiseq高通量测序分别对沉香不同层样品进行细菌群落结构分析.结果 表明,沉香5个分层15个样品共获得1 150 096条优化序列及9 690种OTUs,其物种分属于28个细菌门、61个纲、110个目、212个科和384个属中.进一步分析发现,白木层(NL)细菌物种丰富性最低,OTUs种类最少;沉香层(AL)和NL共有OTUs数量为0,差异较大.同时,NL与其他4层在细菌群落结构及物种多样性方面都存在显著性差异,与过渡层(TL)有部分类似的细菌群落分布,如葡萄球菌科Staphylococcaceae的葡萄球菌属Staphylococcus为二者共同优势菌属;非白木的4层组织中的细菌种类结构相似性较大,共有的4个菌属分别为Acidibacter、慢生根瘤菌属Bradyrhizobium、热酸菌属Acidothermus和鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas,其中前3种菌属占沉香类物质DA层和AL层细菌群落的主导地位,且Bradyrhizobium在AL层最为丰富.研究结果表明,白木香在结香过程中细菌群落多样性及丰富度在宿主中呈递减分布趋势,不同分层的细菌富集具有显著差异性,为揭示细菌如何参与和调控沉香结香的研究提供基础数据.
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篇名
基于Hiseq测序分析沉香不同层的细菌分布特征
来源期刊
中国中药杂志
学科
关键词
白木香
沉香不同分层
细菌物种多样性
细菌群落结构
年,卷(期)
2020,(10)
所属期刊栏目
分子生药学
研究方向
页码范围
2374-2381
页数
8页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.19540/j.cnki.cjcmm.20200302.115
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作者信息
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杨全
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广东药科大学中药学院
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广东药科大学中药学院
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期刊影响力
中国中药杂志
主办单位:
中国药学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1001-5302
CN:
11-2272/R
开本:
大16开
出版地:
北京市东直门内南小街16号
邮发代号:
2-45
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
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36
总被引数(次)
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