水稻黑条矮缩病毒(Rice black streaked dwarfvirus,RBSDV)引起的玉米粗缩病是我国玉米生产中的一类重要病害,严重威胁我国玉米生产.MicroRNA(miRNA)是一类内源的小分子非编码RNA,作为真核生物基因表达中的一类调控因子,在抵御病毒入侵方面起着非常重要的作用.本研究通过对不同抗性玉米品种人工接种RBSDV,构建茎秆及叶片miRNA文库共8个.利用高通量测序,共获得150个已知miRNA前体序列和474个新miRNA序列.miRNA差异表达分析表明,两品种间叶片组织中表达趋势相反的miRNA有17个,茎秆组织中表达趋势相反的miRNA有10个.对差异表达的miRNA进行靶基因预测,共得到1870个靶标基因,通过KEGG和GO富集分析,得出差异表达miRNA的表达模式.本试验为玉米抗粗缩病分子机理研究奠定了基础.