5株类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒全基因组测序及分析

• 作者: 顾瑞恒 常亚飞 李天宇 谭菲菲 王同燕 李向东 田克恭
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: PRRSV 类NADC30 遗传演化分析 重组分析
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 2100-2107
• 页数: 8页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.11.04

摘要

为了解类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的基因组变化情况与分子流行病学特征,对本实验室已鉴定为类NADC30阳性样品进行全基因组测序,共得到5个类NADC30 PRRSV全基因组,并依次命名为180049-1,180770-16,180546-27,180450-1,180253-5.对5株类NADC30毒株的NSP2蛋白进行氨基酸序列比对结果表明:与VR2332株对比,5株毒株在NSP2蛋白322?432,483,504?522位均存在111十1+19个氨基酸的不连续缺失,与已报道类NADC30毒株的缺失特征相同.其中,180546-27毒株在NSP2蛋白除具有与NADC30相同的氨基酸缺失以外,在毒株NSP2蛋白中位置18～23,805～806含有额外的6+2个氨基酸缺失.核苷酸同源性分析结果表明:180049-1,180770-16,180546-27,180450-1,180253-5全基因与CH-1a(谱系8)的核苷酸同源性分别为93.3％,84.8％,86.0％,83.9％和84.4％;与JXA1(谱系8)的同源性分别为96.6％,84.4％,86.3％,83.1％和84.0％;与NADC30(谱系1)的同源性分别为85.7％,93.4％,91.9％,93.7％和93.8％;与QYYZ(谱系3)的同源性分别为86.5％,82.4％,83.0％,81.6％和82.0％;与VR2332(谱系5)的同源性分别为89.0％,85.2％,85.3％,85.0％和85.3％.对ORF5基因和全基因组遗传演化分析表明:180049-1毒株属于谱系8,180770-16,180546-27,180450-1,180253-5毒株属于谱系1中的类NADC30亚群.重组结果表明,180450-1可能由NADC30与VR2332样毒株重组而来,而180049-1,180770-16,180546-27,180253-5可能由NADC30与HP-PRRSV样病毒重组而来.本试验结果为PRRSV流行株的重组、演化分析和防控提供借鉴意义.