69份苦玄参种质SSR遗传多样性及品质性状相关标记分析

• 作者: 吴梦丽 张淼 李耀燕 杨帆 白燕远 谢阳姣 闫国跃 阿里穆斯 高慧
• 来源期刊: 中国实验方剂学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 苦玄参 简单重复序列(SSR)分子标记 遗传多样性 品质性状 相关分析
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 资源与质量评价
• 页码范围: 174-184
• 页数: 11页
• 分类号: R284.2|R289|R22|R2-031
• 语种: 中文
• DOI: 10.13422/j.cnki.syfjx.20200414

摘要

目的:采用简单重复序列(SSR)分子标记技术对广西苦玄参主产区69份苦玄参种质样本进行遗传多样性及亲缘关系分析,并筛选与苦玄参苷含量相关联的优良种质基因.为苦玄参种质资源评价、遗传进化分析及分子标记辅助育种等提供依据.方法:基于转录组测序技术,开发20对引物进行批量扩增.利用各标记位点的遗传多态信息,分析69份苦玄参种质的遗传多样性及亲缘关系,并通过一元线性和多元逐步回归分析,筛选与苦玄参苷含量相关联的分子标记.结果:20对SSR引物共扩增出76个等位基因,平均每个位点观测等位基因3.8个,高于有效等位基因数(1.969 2个),稀有等位基因率为38.2％,等位基因分布不均匀.等位基因多态率范围为0～59％,平均38.24％,各位点多态率差异较大.各位点多态信息含量(PIC)变化范围为0～0.621 1,平均0.378 0;Shannon多态性信息指数变化范围为0～1.240 1,平均0.759 0;Nei's基因多样性指数(Nei)变化范围为0～0.682 3,平均0.440 9;以上3个指标最高的为P21,最低为P7,各位点遗传多样性存在较大差异.各位点平均观测杂合度为0.382 4,低于平均期望杂合度(0.442 5),表现为杂合子缺失;平均遗传分化系数Fst为0.365 9;基因流Nm平均值为0.433 2,种质遗传分化较大,基因流较小.一元线性回归分析和多元逐步回归分析结果表明,与苦玄参苷IA和IB相关的位点各有5个,其中仅有1个位点与2个成分的含量均相关.结论:20个SSR标记位点遗传多样性存在较大的差异,供试69份种质遗传分化大,基因流较小;从供试20个SSR标记中筛选出9个与苦玄参苷含量相关联的标记位点,试验结果可为苦玄参遗传进化分析及良种选育和繁育等提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	闫国跃		38	100	6.0	8.0
2	李耀燕		27	56	4.0	6.0
3	白燕远		27	115	5.0	9.0
4	杨帆		7	1	1.0	1.0
5	吴梦丽		7	1	1.0	1.0
6	高慧		21	138	6.0	11.0
7	谢阳姣		29	66	5.0	7.0
8	张淼		16	15	2.0	3.0
9	阿里穆斯		1	0	0.0	0.0