16S rDNA测序探讨藏族和汉族肠易激综合征患者肠道菌群的差异

• 作者: 万慧敏 宦徽 李骥 涂庆丽 许立 陈茉 魏清
• 来源期刊: 中国临床研究
• 学科: 医学
• 关键词: 肠易激综合征 肠道菌群 藏族 汉族 16S核糖体脱氧核糖核酸 高通量测序
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1601-1606
• 页数: 6页
• 分类号: R574.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.13429/j.cnki.cjcr.2020.12.001

摘要

目的 通过16S核糖体脱氧核糖核酸(16S rDNA)测序方法分析藏、汉族肠易激综合征(IBS)患者的肠道菌群差异.方法 选取2018年4月至2019年1月确诊的藏族(25例)和汉族(20例)IBS患者作为研究对象,采用Illumima Miseq对两组粪便进行16S rDNA测序,并对测序结果进行生物信息学分析.结果 Simpson指数显示,藏族IBS患者肠道菌群的物种多样性显著低于汉族IBS患者(P=0.030 6).物种差异分析显示,藏族IBS组中拟杆菌门(Bacteroidetes)和普雷沃菌_9属(Prevotella_9)丰度以及肠道菌群定植抗力拟杆菌门/厚壁菌门(B/F)值都显著高于汉族IBS组(P =0.016 99,0.000 934 1和0.006 644),而拟杆菌属(Bacteroides)、布劳特菌属(Blautia)和霍氏真杆菌属(Eubacterium-hallii)丰度则显著低于汉族IBS组(P =0.040 91、0.000 108 1和0.036 49).基于未观测状态重建的群落系统发育研究(PICRUSt)功能预测分析显示,藏族IBS组的蛋白质同源群簇(COG)功能分类和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能预测与汉族IBS组之间基本无差异.结论 与汉族比较,藏族IBS患者肠道菌群失调情况较轻,肠道菌群定植抗力增强,致病菌减少,有益菌增加,该结论可为藏族IBS患者的个性化治疗方案提供依据.