汉族与蒙古族肠道菌群结构差异分析

• 作者: 张沐诗 李树春 毛明慧 肖瑶 谢丹
• 来源期刊: 实用医学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 汉族 蒙古族 肠道菌群 16S rRNA
• 年，卷（期）: 2020,（19）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 2639-2644
• 页数: 6页
• 分类号: Q935
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006⁃5725.2020.19.007

摘要

目的 探究汉族和蒙古族人群的肠道菌群差异,为种族?微生物群假说以及以菌群为研究对象的疾病机制研究提供依据.方法 采集同一地区三代纯系汉族和蒙古族共28例志愿者的粪便样本,放置-80℃冰箱保存,并提取粪便菌群的DNA,使用PCR扩增技术,得到16S rRNA基因的V3+V4区PCR扩增产物,之后使用HiSeq2500高通量测序,原始序列使用USEARCH软件生成97％相似度的OTU表,并注释,使用R语言中vegan包作Alpha、Beta多样性分析,edgeR包作差异OTU分析,从而尝试筛选出民族差异菌群.结果 汉族与蒙古族组肠道菌群中共有309个差异OTU,结果证明汉族和蒙古族人群的肠道菌群存在差异,蒙古族肠道菌群中显著高于汉族组的是细菌属有:梭菌Ⅳ(ClostridiumⅣ)、副杆状菌属(Parabac?teroides)、枝菌属(Alistipes),显著低于汉族组的有:瘤胃球菌属(Ruminococcus)、克雷白氏杆菌(Klebsiella)、布劳特氏菌属(Blautia)、毛螺旋菌属(Parasutterella).结论 提示菌群和疾病机制的关联研究应将民族作为潜在影响因素,另外本研究部分验证了种族?微生物群假说.