肺腺癌骨转移癌痛患者外周血转录组学研究

• 作者: 刘德成 唐可京 张朝晖 张辉 林世清 林中原 王益敏 窦云凌
• 来源期刊: 实用医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肺腺癌 骨转移癌痛 RNA-seq 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（21）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 2953-2957
• 页数: 5页
• 分类号: R441.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-5725.2020.21.013

摘要

目的 研究肺腺癌骨转移癌痛(metastatic bone pain,MBP)患者外周血转录组学以阐释其发生发展中的关键基因和通路.方法 选择我院呼吸内科肺腺癌骨转移住院患者11例,其中5例患者符合典型骨转移癌痛表现且疼痛视觉模拟评分≥4分(MBP组),6例视觉模拟评分为0分(C组).收集两组患者外周血进行转录组测序,利用R语言筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并进行生物学功能富集分析.对DEGs进行蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,获得最显著蛋白表达模块及关键基因,并结合TCGA临床数据对关键模块内基因进行生存分析.结果 共获得差异基因共2332个,其中上调基因1647个,下调基因685个.GO和KEGG结果显示,DEGs主要富集在趋化因子转导通路和p53信号转导通路上.通过PPI网络分析及生存分析,筛选出4个关键节点基因(CXCL1、CXCL10、CXCR4和GNG7),其中GNG7与肺腺癌患者生存率密切相关.结论 趋化因子/趋化因子受体CXCL1、CXCL10、CXCR4与GNG7可能作为MBP的重要预测因子和治疗靶点,为临床治疗提供依据.