基于公共数据库挖掘的ACE2肺部表达差异及与新型冠状病毒肺炎的相关性的功能预测

• 作者: 周笳 王宣 王文欣 荣健 颉迎新
• 来源期刊: 中华医院感染学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 金属肽酶中的血管紧张素转换酶2 新型冠状病毒肺炎 信号通路 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（19）
• 所属期刊栏目: 新型冠状病毒肺炎防治专题
• 页码范围: 2881-2885
• 页数: 5页
• 分类号: R563.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11816/cn.ni.2020-201145

摘要

目的 金属肽酶中的血管紧张素转换酶2(Angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)被确定为新型冠状病毒的功能性受体.本研究旨在探究ACE2在新型冠状病毒引起肺炎(以下简称"新冠肺炎")中的表达差异.方法 对GSE42834数据集获得的112个新冠肺炎患者的新冠肺炎组织和18个肺炎患者的正常肺组织的测序结果进行差异分析,设定差异分析的条件是logFC绝对值>1,P<0.05.使用人蛋白质数据库进一步验证ACE2在正常肺组织的表达情况.Coexpedia数据库进行ACE2共表达基因的检索.Metascape对共表达基因进行GO和KEGG富集分析,以便进行预测ACE2在机体发挥的功能以及可能参与的信号通路.结果 GSE42834数据库获得具有差异性表达的基因共有249个,其中上调的基因有156个,下调的基因有93个.上调变化较大的基因有VNN1,ACE2,OLFM4,CD67,CD64,下调变化较大的基因有GNLY,FGFBP2,CLIC3,D4S234E和KLRB1.差异结果分析可见ACE2属于上调基因.组间表达结果提示与正常肺组织相比,ACE2在新冠肺炎组织中的确表达上调,人蛋白质数据库免疫组化结果提示,ACE2在正常肺组织表达阴性.GO和KEGG富集分析和可视化发现ACE2参与介导I型干扰素信号通路和Toll样受体信号通路.结论 ACE2在新冠肺炎患者中可能高表达,有望成为治疗新冠肺炎的新靶点.