玉米杂交种纯度鉴定SNP核心引物的确定及高通量检测方案的建立

• 作者: 王蕊 施龙建 田红丽 易红梅 杨扬 葛建镕 范亚明 任洁 王璐 陆大雷 赵久然 王凤格
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 纯度 SNP KASP 玉米杂交种 核心引物
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 770-779
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2021.03031

摘要

纯度是玉米种子质量的重要指标之一, 尤其杂交种自交株是影响田间产量的关键因素。KASP (kompetitive allele specific PCR)技术具有高通量、低成本的优点, 适用于种子纯度检测。本研究基于12套杂交种及其父母本的三联体样本及335份玉米杂交种国家审定标准样品SNP指纹, 从384个SNP基础位点筛选获得60个候选位点, 位点转化为KASP引物的成功率为95%。综合考虑引物双亲互补率、多态性、稳定性和分型效果等多项指标, 最终确定20个引物作为玉米杂交种纯度鉴定的核心引物, 能够有效鉴定99.7%供试样品纯度。对于待测样品京科968通过SNP-DNA指纹数据库查询, 并选择双亲互补型引物进行纯度鉴定。在检测的110个个体中, 共检出1个自交苗和2个异型株, 纯度为97.3%。同时, 基于纯度核心引物对批量样品检测建立高通量纯度检测方案, 具有快捷、准确、高通量和低成本的特点, 为政府监管和企业提供了更多纯度鉴定方案的选择。