胰腺癌中关键RNA结合蛋白的功能及预后评估价值

• 作者: 陈钦钦 杨凌志 彭心宇
• 来源期刊: 中国现代医药杂志
• 关键词: 胰腺癌 RNA结合蛋白 生物信息学 生存分析 预后模型
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 5-11
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-9463.2021.01.002

摘要

目的 探讨胰腺癌中差异表达RNA结合蛋白(RBPs)的功能及其相关信号通路,构建预后模型评估胰腺癌患者的预后,为胰腺癌的诊断、治疗和预后评估提供新思路.方法 利用TCGA数据库中胰腺癌患者的RNA-Seq数据,运用limma包进行差异分析,将得到的差异表达RBPs进行GO富集分析和KEGG信号通路分析并绘制PPI网络及其子网络.通过survival包筛选预后相关RBPs构建预后模型,并通过生存分析、ROC曲线绘制、风险函数评估、独立预后分析进行验证,绘制列线图有效评估预后.结果 筛选出6个上调RBPs和9个下调RBPs,构建了由ESRP1、TDRD6、RBM6、DARS2组成的预后模型并进行验证.结论 筛选差异表达的RBPs并构建预后模型,可为探讨胰腺癌的发病、诊断和药物治疗靶点提供方向.