基于生物信息学验证CCR5参与类风湿关节炎发生发展的遗传学和组织学证据

• 作者: 王友强 兰由玉 李世勇
• 来源期刊: 西南医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 类风湿关节炎 CCR5 生物信息学
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 16-21
• 页数: 6页
• 分类号: R593
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2096-3351.2021.01.003

摘要

目的:通过生物信息学和实验方法探寻CC趋化因子受体5(CCR5)在类风湿关节炎(RA)的表达情况,以此验证CCR5参与RA发生发展的遗传学和组织学证据,并为后续利用RA大鼠模型研究CCR5的作用机制奠定基础.方法:在Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中以"rheumatoid arthritis"为关键词检索RA的基因芯片GSE 97779、GSE 77298、GSE 10500、GSE 55457和GSE 1919,利用生物信息学分析工具GEO2R和limma包筛选差异基因以了解CCR5的表达情况,再通过免疫组化、qRT-PCR和Western Blot验证CCR5在RA大鼠中的异常表达情况.结果:在GSE 1919、GSE 97779、GSE 77298、GSE 10500、GSE 55457芯片中,CCR5在RA患者呈异常高表达,且CCR5是唯一在5个芯片均差异表达的基因.给大鼠注射弗氏完全佐剂10 d后,RA组大鼠关节炎指数(AI)明显升高,且随时间增加逐渐上升,至25 d时AI(7.12±1.13)较10 d(1.21±0.73)、15 d(4.87±1.21)时进一步增高(P<0.05);HE染色提示,RA组滑膜组织有较多炎性细胞浸润,可见新生血管形成,由此可见RA大鼠模型构建成功.免疫组化、qRT-PCR和Western Blot均提示RA组滑膜组织CCR5的表达水平较control组明显升高,与生信分析结果一致.结论:CCR5在RA患者及RA大鼠中均呈高表达,利用生物信息学和实验方法验证CCR5参与RA发生发展的遗传学和组织学证据是可行的,也为后续利用RA大鼠模型研究CCR5的具体作用机制奠定了理论基础.