基于SNP遗传图谱定位甘蓝型油菜分枝角度QTL

• 作者: 汪文祥 储文 梅德圣 成洪涛 朱琳琳 付丽 胡琼 刘佳
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 分枝角度 60K SNP 芯片 QTL 位点 候选基因
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 37-45
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.84042

摘要

分枝角度是油菜株型的重要性状，与油菜的耐密植性密切相关。本研究利用油菜分枝角差异显著的育种亲本材料1098B(分枝角小)和R2(分枝角大)杂交获得F1，通过小孢子培养获得含163份株系的DH群体。以油菜60KSNP芯片进行DH群体基因分型，构建高密度遗传图谱，并利用QTLCartographer2.5对2个环境下油菜顶端分枝角和基部分枝角进行QTL分析。结果表明，构建的高密度遗传图谱覆盖甘蓝型油菜19条染色体，包含9521个多态性SNP标记，1442个簇(bin)，覆盖基因组长度为2544.07cM，相邻簇(bin)之间平均距离为1.76cM。在此图谱基础上采用复合区间作图法(CIM)，在2个环境下检测到17个分枝角度QTL，分别位于A01、A02、A03、A06、A09、C02、C03、C04、C06和C08染色体上，单个QTL解释的表型变异为6.39%~21.78%。用比较基因组方法与拟南芥分枝角度同源基因区间比对，鉴定出其中6个QTL的12个候选基因。其中位于A03连锁群QTL在2年的试验中被重复检测到，根据物理位置和基因组信息推测VAMP714为分枝角度的候选基因。这些QTL和候选基因将为油菜分枝角度的遗传改良提供有用的信息。