玉米开花期相关的 Indeterminate domain (IDD)蛋白家族基因的鉴定

• 作者: 李云富 王静贤 杜艳芳 邹华文 张祖新
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 玉米(Zea mays L.) 开花期 IDD蛋白家族 关联分析 重测序
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 499-507
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.83068

摘要

开花期是影响玉米产量的重要因子之一。Indeterminate1(ID1)编码玉米Indeterminatedomain(IDD)家族蛋白，是玉米开花期的重要调控因子。然而，其他玉米IDD蛋白家族基因及其生物学功能有待深入研究。本文利用生物信息学技术在玉米基因组中鉴定并分离了37个IDD家族基因，记作ZmIDD。表达分析发现这些ZmIDD基因在8个玉米组织中显示出多种表达模式。为进一步探讨ZmIDD基因在调控玉米开花期上的作用，检测了37个ZmIDD在172个自交系中的遗传多样性，发现35个ZmIDD基因在自交系间具有多态性，平均每个基因具有37.8个多态性位点。关联分析鉴定到包含ID1在内的7个ZmIDD基因在多个环境下与开花期性状显著关联。对Zm00001d020683基因2kb的启动子区和600bp编码区重测序，共鉴定到64个多态性位点。候选基因关联分析鉴定到2个启动子区的插入缺失(In/Del)位点与开花期显著关联，其中2个位点分别插入3bp和2bp的单倍型为一种提早开花的基因型。研究结果为玉米开花期相关基因的分离和利用研究提供了候选基因和选择靶点。