基于SSR分子标记的油梨种质遗传多样性分析

• 作者: 周海兰 李绍鹏 李茂富 庞新华 周俊岸 欧景莉 李菊馨 单彬 唐桓伟 李季东
• 来源期刊: 中国南方果树
• 关键词: 油梨 遗传多样性 SSR标记 聚类分析 主成分分析
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 31-37
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13938/j.issn.1007-1431.20200354

摘要

用23对SSR多态性引物对收集的54份油梨种质材料进行PCR扩增,利用Popgene 1.32计算遗传多样性参数,采用NTSYSpc 2.1计算种质间的遗传相似系数,并进行UPGMA聚类分析和主成分分析.结果表明,23对SSR引物共扩增出多态性位点119个,每对引物扩增的多态位点在2?10个之间,平均为5.17个,多态性位点百分比(PPL)为100％;多态性信息量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon's信息指数(I)分别为0.33、1.321 9、0.205 9、0.335 60 54份油梨种质资源的遗传相似系数在0.59～0.97之间,在0.71处可划分为4大类群,Fuerte单独归为第Ⅰ类,Hass、Bacon为第Ⅱ类,第Ⅲ类的种质包括Yl-10、Y3-1、Y6-5、Y10-1,余下47份归为第]类,占参试材料的87.04％,主成分分析结果与聚类分析结果基本一致.