低温胁迫下马铃薯的数字基因表达谱分析

• 作者: 杨慧菊 郭华春
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 马铃薯 低温胁迫 基因表达谱 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 454-463
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2017.00454

摘要

以马铃薯品种合作88为材料，利用数字基因表达谱(DGE)技术，对–2℃低温胁迫处理后的马铃薯叶片cDNA文库进行差异基因表达谱分析。结果表明，有28505个基因受低温胁迫诱导差异表达，其中上调表达基因13703个，下调表达基因14802个。GO功能显著性富集分析表明，DEGs主要涉及信号生物代谢过程、氧化还原过程、能量代谢、次生代谢过程以及催化活性。KEGG富集分析表明，上调表达基因主要富集于苯丙烷、光合作用天线蛋白、类胡萝卜素的生物合成、苯丙氨酸代谢及淀粉与蔗糖代谢途径，而下调表达基因主要富集于植物激素信号转导途径。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证4个DEGs在低温胁迫条件下的差异表达，其结果与DGE分析结果基本一致，证实了DGE测序结果的可靠性。