主要麻类作物的ITS序列分析与系统进化

• 作者: 张力岚 王俊 万雪贝 徐益 张列梅 方平平 祁建民 张立武
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 麻类作物 ITS 系统位置 进化关系
• 年，卷（期）: 2022,（6）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 862-874
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2017.00862

摘要

比较主要麻类作物和测序植物间的ITS序列，可明确它们间系统位置和进化关系。本研究采用PCR扩增和搜索GenBank数据库，获得32份麻类作物和11份测序作物的核糖体内转录间隔区(internal transcribed spacers，ITS)序列，利用MEGE软件分析ITS长度、G+C含量与同源性百分比差异。结果表明，黄麻属、红麻属、苎麻属和亚麻属的ITS基本序列全长分别为963、939、658和686bp;G+C含量分别为57.87%、58.03%、59.05%和53.75%。黄麻属变异区域集中在220~386bp间，红麻属变异区域集中在2个区段(206~347bp，599~713bp)，苎麻属ITS变异区域分布在4个区段(158~163bp、193~199bp、288~333bp和681~688bp)，亚麻属ITS变异区域分布在5个区段(219~229bp、235~240bp、427~432bp、468~484bp和588~594bp)。系统位置分析表明，红麻属与棉花亲缘关系最近，黄麻与棉花亲缘关系较近;亚麻与苎麻各为一小支。系统位置分析与传统的植物分类结果较一致。研究主要麻类作物比较基因组学时，红麻、黄麻可参考棉花，苎麻可参考杨树或蓖麻。推测红麻属的进化时间约为33.7百万年前(million years ago，MYA)，黄麻属约为65.3MYA，苎麻属约为67.5MYA，亚麻属约为90.5MYA。主要麻类作物进化时间越久，同属不同种之间ITS变异区段越多。