乳腺癌增强子-miRNA调控网络识别与分析

• 作者: 钱明明 谭政堂 王文著 李昶蓥 邱正良 郭志云
• 来源期刊: 生命科学研究
• 关键词: 癌症基因组图谱(TCGA) 乳腺癌 增强子 微RNA(miRNA)
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 生物信息学|BIOINFORMATICS
• 页码范围: 64-69
• 页数: 6页
• 分类号: Q523+.1|R737.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.16605/j.cnki.1007-7847.2020.03.0130

摘要

乳腺癌发病率位列女性恶性肿瘤之首.先前研究表明增强子可通过调控miRNA影响肿瘤的发生发展.然而,增强子与miRNA在乳腺癌中形成何种调控网络目前尚不清楚.为了探究乳腺癌中增强子与miRNA形成的调控网络,通过分析 112个乳腺浸润癌样本和104个正常组织样本,共识别了 220对增强子-miRNA调控关系,其中包括220个增强子、56个乳腺癌失调miRNAs.生存分析表明,6个miRNAs(hsa-mir-195、hsa-mir-671、hsa-mir-3619、hsa-mir-4664、hsa-mir-5003、hsa-mir-5691)的表达水平显著与乳腺浸润癌患者的生存时间相关.进一步的GO/KEGG功能富集分析显示,这6个miRNAs的靶基因显著富集在癌症相关生物学进程与信号通路上.对这6个miRNAs的靶基因进行驱动基因与网络分析,共识别了 6个网络关键节点,其中TP53、CCNE2的基因显著与乳腺浸润癌患者的生存时间相关.以上结果为探索增强子与miRNA在乳腺癌中的调控机制提供了理论与方法基础.